В 1829 году, после длительныхвойн России с Турцией за Черноморское побережье Кавказа, по Андрианопольскому договору восточное побережье Черного моря отошло к России. Для охраны Черноморского побережья Кавказа, от Анапы до Поти строится более 20 фортов, крепостей и укреплений, образовавших Черноморскую береговую линию. Первое из них было возведено в августе 1831 года генералом Е.А. Берхманом на берегу Геленджикской бухты. В период военной колонизации Черноморского побережья крепость являлась опорным пунктом русских войск и базой отряда военных кораблей Черноморского флота.
23 июля (4 августа по новому стилю) 1831 года у берегов Геленджикской бухты появился русский военный флот. С 15 кораблей был высажен десант в составе 4138 человек под командованием генерал-майора Берхмана, который вступил в рукопашный бой с горцами и закрепился на берегу. Цель десанта – строительство крепости в районе Тонкого. При обследовании местности от решения заложить крепость в районе мыса пришлось отказаться из-за заболоченности и недостатка питьевой воды. Укрепление строится в устье реки Ашампе (район городского стадиона, ориентировочно на современные улицы – Островского, Курзальная, Кирова).
Строительные материалы пришлось добывать на месте, строительство укрепления затянулось на несколько лет, ибо велась в высших штабах дискуссия, где строить основное укрепление в Геленджике или Цемесской бухте.
С началом Крымской войны (1853-1856 гг.) Черноморская береговая линия попала в тяжелое положение: ей грозила опасность с двух сторон – и с моря, и с суши. По настоянию Л.М. Серебрякова (с 1851 г. начальника всей Черноморской береговой линии от Анапы до турецкой границы) все средние укрепления были упразднены: гарнизоны были сняты, а они взорваны. Геленджикское укрепление просуществовало до 1854 года. В марте 1854 года из Новороссийска в Геленджикскую бухту прибыли транспортные суда и пароходы. На них были погружены раненые солдаты, провиант, орудия, порох и снаряды. Оборонительные сооружения Геленджикского укрепления были взорваны, строения в укреплении и форштадте были сожжены. 30 марта с наступлением темноты гарнизон с двумя орудиями под командованием генерал-майора Вагнера покинул ликвидированное Геленджикское укрепление, соединившись по пути с Кабардинским гарнизоном, проследовал в Новороссийск.
В 1855 году оставшиеся русские крепости были атакованы англо-франко-турецкой эскадрой, разрушены бомбардировкой и практически тоже прекратили своё существование. После окончания Крымской войны по Парижскому договору России не разрешено было восстанавливать Черноморскую береговую линию.
Вскоре горцы, придя на развалины бывшего Геленджикского укрепления, обосновались здесь. В июле 1857 года русский генерал-майор Филипсон, высадившись с моря с войсками, овладел возникшими укреплением. В качестве трофеев ему досталось 6 орудий, значительное количество военных и продовольственных припасов.